大家好,今天小编关注到一个比较有意思的话题,就是关于如何避免引物二聚体的问题,于是小编就整理了4个相关介绍的解答,让我们一起看看吧。
pcr曲线不平滑是怎么回事?
做个阳性对照,如果还是不平滑的话那就是你的试剂盒出了问题,需要更换
PCR(聚合酶链反应)曲线不平滑可能由以下原因导致:
1. 引物特异性问题:PCR反应中使用的引物可能存在非特异性杂交或引物二聚体等问题,这可能导致PCR产品在扩增过程中出现不平滑的曲线。
2. 模板DNA的纯度问题:PCR反应中的模板DNA可能存在杂质或降解,导致PCR反应出现不规则的曲线。
3. 审查控制标准:PCR反应中的阴性对照和阳性对照可能出现问题,或者PCR反应的控制标准(如反应体系的浓度、pH值等)不合适,这可能导致PCR曲线不平滑。
4. 反应条件问题:PCR反应的温度、时间和鸟嘌呤和胸苷的浓度等反应条件可能不合适,导致PCR反应产物的扩增速度不均匀。
pcr的空白要加引物吗?
空白是要看模板是否污染,所以是要加引物的。
加引物
为了排除引物产生引物二聚体(dimer)带来的假阳性和结果误差。
PCR过程中两种引物之间一般不存在对应碱基互补成对现象,对吗?为什么?
有可能会存在的,所以才需要在设计的时候尽量避免掉,两种引物互补会表现为在琼脂糖凝胶电泳上出现引物二聚体的条带,这个需要再设计引物的时候花功夫。
ssr引物设计原则和注意事项?
1、首先引物与模板的序列要紧密互补。
2、其次引物与引物之间避免形成稳定的二聚体或发夹结构。
3、再次引物不能在模板的非目的位点引发DNA聚合反应即错配。
4、引物是人工合成的两段寡核苷酸序列,一个引物与目的基因一端的一条DNA模板链互补,另一个引物与目的基因另一端的另一条DNA模板链互补。
引物自身及引物之间不应存在互补序列。连续互补的碱基应该要少于4 个。引物
应使其△G 值不要太高,△G 值越大,则双链越稳定。
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引物长度和GC 含量要适中。引物长度大概为18~28 bp,但不应大于38 bp,引物过短会影响到扩增的特异性,太长的话其延伸温度将会大于74 ℃,不利Taq 酶的催化反应。若扩增产物为4~5 kb,引物最好不要少于24bp;如果目的产物≤500 bp,引物长度只要16~18 bp 即可。上下游引物间的Tm 值的差值最好在10 ℃以内,GC 含量最好是40%~60%。
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3′端不应该存在相似性高的序列,否则容易导致错配。3′端不能有多于3 个连续的G 或C,要不然引物错配会在GC 富集区。
到此,以上就是小编对于如何避免引物二聚体的形成的问题就介绍到这了,希望介绍的4点解答对大家有用,有任何问题和不懂的,欢迎各位老师在评论区讨论,给我留言。